โรงเรียนบางยี่ขันวิทยาคม มีเส้นทางเข้าถึงโรงเรียน 3 เส้นทาง ดังนี้
1. เส้นทางแรก จากถนนจรัญสนิทวงศ์ เลี้ยวซ้ายเข้าซอยจรัญฯ 42 ตรงเข้ามาประมาณ 300 เมตร จะพบป้ายบอกทางเข้าโรงเรียน เลี้ยวซ้ายอีก 1 ครั้ง ประมาณ 100 เมตร จะถึงประตูเข้าโรงเรียน เส้นทางนี้สามารถนำรถยนต์เข้าจอดในลานโรงเรียนได้
2.เส้นทางที่สอง เป็นทางเดินเท้าเล็ก แยกมาจากซอยจรัญฯ 44 สามารถนำรถจักรยานหรือรถจักรยานยนต์วิ่งได้
3.เส้นทางที่สาม เป็นทางเดินเท้าแยกมาจากซอยจรัญฯ 44 เช่นเดียวกัน ผ่านดงดิบแล้วจะบรรจบกับเส้นทางที่สอง